El trabajo del CRCE en el ámbito del Paludismo, se ha centrado en tratar de mejorar los niveles de salud de la población de Guinea Ecuatorial mediante acciones de control que lleven a una disminución de la morbilidad y mortalidad por causa de esta endemia, principal problema de salud del país.

Las acciones que se han llevado a cabo abarcan todo el abanico de recomendaciones de la iniciativa “Hacer Retroceder el Paludismo” (Roll Back Malaria) lanzada conjuntamente por la Organización Mundial de la Salud, el Fondo de las Naciones Unidas para la Infancia (UNICEF), el PNUD y el Banco Mundial en mayo de 1998.

Las acciones previstas en las diferentes formulaciones del proyecto CRCE han sido de tipo preventivo-curativo:

• Promoción del uso de medidas individuales de protección contra la picadura de mosquitos (telas mosquiteras de  cama impregnadas de insecticida).
• Educación sanitaria a la población sobre la enfermedad y su prevención.
• Mejora del diagnóstico precoz de la enfermedad, con la capacitación de los técnicos de laboratorio y la dotación de reactivos.
• Formación en el manejo y tratamiento correcto de enfermos.  
• Incorporación de nuevas tecnologías más sensibles y específicas para el diagnóstico y tratamiento.
• Vigilancia y seguimiento de las resistencias a antipalúdicos (estudio in vito).

Para la ejecución de estas actividades se ha contado con el apoyo de los Laboratorios de Referencia de Paludismo de los Hospitales Regionales de Bata y Malabo. Estos laboratorios, puestos en marcha en etapas anteriores de la asistencia técnica del ISCIII al Programa Nacional de Lucha contra el Paludismo, han servido como plataforma sobre la que desarrollar las formaciones en el ámbito del diagnóstico y, llevar a cabo la vigilancia epidemiológica y el monitoreo de las resistencias a diferentes regímenes terapéuticos. Además, estos laboratorios se han responsabilizado del diagnóstico de paludismo de rutina de los niños menores de 9 años que acudían a la consulta de pediatría de los dos Hospitales Regionales. Hasta el año 2003, se ocuparon igualmente del diagnóstico de paludismo a mujeres gestantes que acudían a la maternidad de dichos hospitales.

A nivel de investigación aplicada se han desarrollado líneas de trabajo dirigidas a aumentar el nivel de conocimiento de la enfermedad en Guinea Ecuatorial y proporcionar la información necesaria para la toma de decisiones en el marco de la política sanitaria del país, como la reciente actualización del Protocolo Nacional Terapéutico. Esta actividad investigadora se ha divulgado ampliamente en revistas científicas, congresos de ámbito nacional e internacional, así como en foros de diversa índole.